در تازهترین برآوردها، هزینه اجرای پروژههای طرح نهضت ملی مسکن به دلیل افزایش قیمت مصالح ساختمانی، دستمزد نیروی کار و هزینههای اجرایی با رشد قابل توجهی روبهرو شده است. این افزایش هزینهها موجب شده است آورده متقاضیان در برخی پروژهها تعدیل شود و تکمیل واحدها نیز به تأمین منابع مالی و تسهیلات بانکی وابستهتر از گذشته باشد. کارشناسان تأکید میکنند مدیریت هزینهها، تسریع در پرداخت تسهیلات و تأمین بهموقع منابع مالی، نقش تعیینکنندهای در تکمیل پروژهها و جلوگیری از افزایش بیشتر قیمت تمامشده واحدهای نهضت ملی مسکن خواهد داشت.